Charakteristika testování virů - nejen COVID 19
Jaký je ideální test
Ideální test na Coronavirus
V tomto článku se nebudeme zabývat způsobem testování Coronaviru. O přesnosti a nepřesnosti jakékoliv metody si můžeme povídat v okamžiku, až každý z nás bude mít nejen soupravu PCR , ale zároveň si bude schopen například sestavit sekvenci nukleotidů, ověřit čistotu materiálu, pracovat v podmínkách naprosté sterility. Pak snad každý z nás pochopí, že laboratorní výsledky nejsou jednoznačné. Na druhou stranu nám nic nebrání začít experimentovat. PCR přístroj si seženeme za 400 dolarů a pak již můžeme bádat. Nebo si sestavíte LAMP ? Možná by to šlo, stačí si naprogramovat arduino, malé bastlení a budete mít přístroj, který bude primitivní, ale jistě vám umožní zhruba provést základní testy. 15 letý puberťák může naučit bakterii svítit viz https://www.the-odin.com/genetic-engineering-home-lab-kit/, tak proč ne My. Takto sepsaný ůvod je samozřejmě provokací. Cílem následujícího článku je podat zjednodušené vysvětlení efektivity testů na odhalení virové infekce. A protože bez matematiky není žádná věda vědou pro srozumitelné vysvětlení použijeme následující řádky. Tento příklad bude vlastně aforismem ze zkušeností získaných při minulé epidemie SARS, kdy jej použili lidé, kteří se diagnostikou viru setkali .
Jaké vlastnosti musí mít ideální test na přítomnost Coronaviru v současnosti ?
Pokud chceme utratit miliardy za testování Coronaviru budeme po testu chtít - jistě po těch 150000 nových testech které jsme objednali z Číny
1. Aby byl levný
2. Aby byl přesný
3. Aby by rychlý
Co je levný test, nebudeme řešit v systému českého zdravotnictví. Každý má nárok na zdravotní péči i když nikdo nedefinoval co zdravotní péče což představuje Ďábla ukrytého v detailu. Například placení činnost sexuálních pracovníků pro zdravotně mentálně postižené v rámci výkonů zdravotních pojišťoven by mohlo být dalším cílem bojovníků proti diskriminaci. Otázka ceny testu je tedy nejhůře definovaná. Přesnost testu se dá definovat v rámci matematických modelů, například v rámci specificity a senzitivity testu, ale zároveň musí brát do úvahu reálné schopnosti laboratoří, jejich vybavení personální a přístrojové. Samozřejmě čím více senzitivní a čím více specifické testy jsou tím lépe. Rychlost testu může být výrazným faktorem úspěchu. Některé metody trvají minuty , jako je stanovení hladiny cukru z prstu, některé i týdny- kultivační stanovení přítomnosti bakterií tuberkulosy. Samozřejmě v případě krátké doby infekčnosti viru , by se mělo jednat pouze o několik hodin. Nyní se dostáváme k matematice efektivity testu Coronaviru. Pro výpočet kvality současného testování nyní použijeme kombinatoriku. Náš současný test na přítomnost Coronaviru bude mít pravděpodobně jako u testu na SARS mít všechny dobré vlastností, ale pouze vždy pouze dvě současně jako v případě minulé epidemie a bude mu scházet jedna zbývající vlasnost.
1. Levný bude L
2. Přesný bude P
3. Rychlý bude R
Pokud budeme kombinovat dostaneme následující možné kombinace.
LP | LR | PR |
1. LP Použitý ideální test na Coronavirus bude tedy levný a přesný ale strašně, strašně pomalý
2. LR Použitý ideální test na Coronavirus bude tedy levný a rychlý ale strašně, strašně nepřesný
3. PR Použitý ideální test na Coronavirus bude tedy přesný a rychlý ale strašně,strašně drahý
Jak kvalitní test bude vyšetření na Coronavirus v současné době a kterým kvalitám dáme přednost?
Související